生物有機肥是帶有非常多的有益微生物的有機肥料，其實就是一些有機質肥料上，帶有非常多的微生物。這種肥料主要作用是為土壤提供豐富充足的微生物，來分化土壤里的有機質，轉化變成作物所需要的氮磷鉀營養物質。

生物有機肥，與秸稈還田配合使用，能夠盡快地分化土壤里的秸稈和其它的農殘有機質，轉化為作物所需要的氮磷鉀營養物質，供作物生長發育，提高產量的需要。

生物有機肥是以有益微生物和有機物料（植物秸稈、禽畜糞便、豆餅等）復合而成的兼具微生物菌肥和有機肥的肥料。由于生物有機肥中含有大量的有益菌，這些有益菌能改善作物根際微生物群，不僅能增加土壤肥力、阻止病菌入侵，還能使蔬菜增產、增質。